Z punktu widzenia informatycznego, to poszukiwanie podgrafów o zadanej strukturze, w całym grafie. Macierz A, grafy K4 i takie tam. Eh, przypomniały się stare dobre czasy i... algorytmy.
czwartek, 7 lipca 2011
Physical Modeling of Complex Systems
Z punktu widzenia informatycznego, to poszukiwanie podgrafów o zadanej strukturze, w całym grafie. Macierz A, grafy K4 i takie tam. Eh, przypomniały się stare dobre czasy i... algorytmy.
sobota, 2 lipca 2011
Scanning Probe Microscopy
- Advances in atomic force microscopy, Franz J. Giessibl
- Atomic force microscopy and spectroscopy, Yongho Seo, Wonho Jhe
Egzamin jak zwykle ustny, po jednym z każdej części.
piątek, 1 lipca 2011
Nanobiology
sobota, 18 czerwca 2011
Computational Methods in Solid State Physics
Część laboratoryjna polegała na wyznaczeniu struktury pasmowej NaCl i Grafenu. Można było zapoznać się z pakietem SIESTA a także poznać od kuchni jak takie obliczenia się przeprowadza. Rezultatem miał być raport, który należało przedstawić podczas egzaminu.
- Czas trwania
- 28h
- ECTS
- 3
- Poziom trudności
- Advanced
- Sylabus
wtorek, 1 marca 2011
Nanostructured Bio-Macromolecules
środa, 23 lutego 2011
Mesoscopic Physics
- Czas trwania
- 28h
- ECTS
- 3
- Poziom trudności
- advanced
- Form egzaminu
- close book
- Sylabus
niedziela, 20 lutego 2011
Determination of Biomolecular Structures
Celem kursu jest przegląd z dwóch głównych metod określania struktury biomolekuł: spektroskopii NMR i dyfrakcji rentgenowskiej.
- Czas trwania
- 36h
- ECTS
- 6
- Poziom trudności
- advanced
- Form egzaminu
- open book
- Sylabus
Pierwsza część traktowała o technice NMR. Przedstawiono możliwości i ograniczenia spektroskopii NMR jako techniki badania makrocząsteczek biologicznych. Technika ta jest coraz bardziej zaangażowany w badania cząsteczek, takich jak białka i kwasy nukleinowe. Wykład rozpoczynał się od podstawowych informacji na temat NMR, zaprezentowano 1D,następnie omówiono tryb 2D i 3D. Omówiono kilka typów dwuwymiarowej spektroskopii NMR, tj. COSY, NOESY, TOCSY, HETCOR, HMQC, TROSY. Następnie zaprezentowano na konkretnych przykładach wykorzystanie tej techniki do rozwiązania struktury DNA, RNA a także białek.
Druga część omawiała technikę dyfrakcji rentgenowskiej. Wykład składał się z dwóch części. Pierwsza omawiała podstawowe zagadnienia z krystalografii, druga natomiast przedstawiała typowe metody otrzymywania krystalizacji białek. Następnie omówiono budowę dyfraktometrów, typy lamp rentgenowskich. Ostatnia fragment zawierał omówienie metod rozwiązywania struktury i otrzymania mapy gęstości elektronowej.
Egzamin składał się z dwóch części. Pierwsza dotyczyła spektroskopii NMR, należało omówić artykuł jaki wcześniej się wybrało. Zaprezentować metodę, omówić wady i zalety w danym przypadku, następnie odpowiedzieć na dodatkowe pytania z kursu. Druga część dotyczyła XRD w takiej samej formule.
piątek, 18 lutego 2011
Computational Physics: Advanced Monte Carlo Methods
Kolejny interesujący kurs. Właściwie moje pierwsze spotkanie z praktyczną implementacją symulacji wykorzystujących metodę Monte Carlo.
- Czas trwania: 20h
- ECTS: 3
- Poziom trudności: Basic
- Form egzaminu: open book
- Sylabus
Rozszerzeniem kursu jest Physical Modelling of Complex Systems.
Egzamin polegał na zaprezentowaniu wyników z ćwiczeń jakie się zrealizowało. Trzeba było omówić zarówno otrzymane wyniki jak i kod programu a także odpowiedzieć na dodatkowe pytania z teorii.
Advanced Fluorescence and Fluorescence Microscopy. From Single Molecules to Biological Systems
środa, 16 lutego 2011
Semiconductor devices
Semiconductor devices
- Czas trwania: 28h (wykład+ćwiczenia)
- ECTS: 3
- Poziom trudności: introductory
- Forma egzaminu: open book